La Evaluación busca establecer los efectos e impactos del Programa sobre los hogares beneficiarios y en su entorno, estableciendo el nivel de logro en relación al cumplimiento de los objetivos del Programa, estableciendo los factores estratégicos determinantes en ello. La evaluación se realiza en determinados perÃodos de tiempo y se concentra en los indicadores de efectos (resultados iniciales) y de impacto (resultados finales). AsÃ, la Evaluación se orienta a establecer la sostenibilidad del Programa a fin de determinar si el impacto logrado se mantiene.
Durante su operación, el Programa ha contado con evaluaciones externas, que abordan diversos aspectos: percepciones de los beneficiarios, lecciones aprendidas, factores de diseño, etc. Los mismos que se han desarrollado el marco del Plan de Evaluación del Programa JUNTOS 2010-2013: “Gestión Basadas en las Evidenciasâ€; en ese sentido,  se pone a disposición del público en general los estudios de Evaluación, tanto cuantitativos y cualitativos, impulsados por el Programa JUNTOS:
Plan de Evaluación del Programa JUNTOS 2010 – 2013
Autor: Unidad Gerencial de Planificación, Presupuesto y Evaluación – JUNTOS
Fecha de Publicación: Julio 2010
Autor: Juan Arroyo Laguna
Estudios y análisis de insumos para el Manual de Operaciones del Programa JUNTOS 2010
Autor: Banco Interamericano de Desarrollo
Fecha de publicación: Julio – Octubre 2009
Informe Compilatorio: El Programa JUNTOS, Resultados y Retos
Autor: Carlos E. Aramburú
Fecha de publicación: Agosto 2009
Analisis Situacional de la Politica Social en el Distrito de Chuschi
Autor: Unidad Gerencial de Planeamiento, Presupuesto y Evaluación
Fecha de publicación: Julio 2009
Microsimulador de Transferencias Condicionadas en Educacion para el Programa JUNTOS
Autor: Juan José DÃaz – GRADE
Fecha de publicación: Junio 2009
Autor: UNFPA, IEP, UNICEF
Fecha de publicación: Marzo 2009
Welfare impacts of the “Juntos†Program in Peru: Evidence from a non-experimental evaluation
Autor: Elizaveta Perova and Renos Vakis – The World Bank
Fecha de publicación: Marzo 2009
Presupuesto Público Evaluado: Programa Nacional de Apoyo Directo a los Más Pobres “JUNTOSâ€
Autor: Mario Alfredo Arróspide Medina – PCM
Fecha de publicación: Febrero 2009
Autor: IEP Instituto de Estudios Peruanos
Fecha de publicación: Febrero 2009